Имя: выборочное;
Возраст: 29 лет;
Пол: выборочный;
Раса: землянин;
Класс: выборочный.

Главный герой всея игры, при создании которого можно будет выбрать некоторые параметры, такие как пол, внешность, детали прошлого и т. д. Также, игрок на протяжении всей игры будет самостоятельно определять модель поведения Шепарда: от доброго и бескорыстного до хамского и циничного, (во второй части от поведения будет зависеть и то, какую внешность будет носить сам капитан, от миловидной и человечной (хороший Шепард), до шрамированной и с выступающими металлическими элементами (плохой Шепард).

Имя Шепарда по умолчанию Джон (мужской вариант) или Джейн (женский вариант). Женскую версию Шепарда озвучила Дженнифер Хейл, мужскую — Марк Мир. В отличие от многих игр с настраиваемой внешностью персонажа, в мире Mass Effect уже задана внешность по умолчанию соответственно для мужского и женского персонажа. В рекламной кампании игры использовался именно мужской вариант Шепарда по умолчанию (в качестве модели лица послужила внешность голландского манекенщика Марка Вандерлоо).

Независимо от решений игрока, Шепард станет Спектром, предотвратит возвращение пожинателей через ретранслятор Цитадели, будет убит коллекционерами и, после восстановления "Цербером", уничтожит их.

Звание "капитан" — проблема локализации: Шепард носит воинское звание "капитан 3-го ранга" (англ. Lieutenant Commander), которое в оригинале сокращается до просто "коммандер" (англ. Commander), а в русской для благозвучности сокращено до "капитан". В начале Mass Effect он является лишь одним из подчинённых капитана корабля "Нормандия" Андерсона, хотя в локализованной версии и Шепарда, и Андерсона называют "капитанами". Так как официально в Mass Effect 2 Шепард мёртв/мертва, воинское звание у него/неё отсутствует, но, несмотря на это, его/её часто называют "капитаном".

Игра предусматривает 9 вариантов прошлого игрока, каждый из которых включает в себя один из трёх вариантов событий до службы в Альянсе Систем (колонист, землянин и скиталец) и один из трех — во время (герой войны, уцелевший и безжалостный).

До службы:
Колонист: детство Шепарда прошло в колонии, родители погибли во время атаки работорговцев.
Землянин: Шепард — сирота, вырос на улице.
Скиталец: родители Шепарда — военные, служили в различных частях Космоса.

Во время службы:
Герой войны: спас/спасла от захвата колонию Альянса Элизиум.
Уцелевший: во время очередного задания погиб весь отряд Шепарда.
Безжалостный: выполнил/выполнила задание ценой жизней подчинённых.

По умолчанию Шепард является землянином и уцелевшим.

Помимо этого, игрок может самостоятельно выбрать класс персонажа из перечисленных ниже вариантов:

Солдат

Солдаты используют наглазный синоптический процессор, позволяющий им вести стрельбу по выбранным объектам более прицельно. Расстреливают ли они Гетов издалека или же рвут на части несколько близко подошедших Ворча залпами дробовика, Солдаты могут устранить любую помеху шквалом огня. Это единственный из классов, способный использовать штурмовые винтовки, равно как и все остальные возможные виды вооружения и боеприпасов. Когда Солдаты задействуют способность Напор адреналина, время для них замедляется, даря им секунды преимущества, чтобы твёрдо прицелиться и поразить врагов. Вдобавок, когда битва накаляется, Солдаты могут применить Сотрясающий выстрел, взрывной волной сбивающий с ног окружающих противников.

Полный перечень способностей:
- Напор адреналина
- Оглушающий выстрел
- Зажигательные боеприпасы
- Криопатроны
- Дезинтегрирующие боеприпасы

Адепт

Адепт, снабженный имплантами L5x, это специалист, способный выводить из строя или убивать врагов при помощи своих биотических способностей. Адепты - единственный класс, способный вызвать Сингулярность - смертельную биотическую ловушку. Когда враги прячутся за преградой, адепт может использовать способность "Притяжение" и вытянуть их из укрытия. Адепты могут использовать способность "Толчок" и скидывать врагов со скал и уступов. Адепт - игровой класс, способный расправиться с врагами без единого выстрела.

Полный перечень способностей:
- Деформация
- Толчок
- Притяжение
- Сингулярность
- Ударная волна

Страж

Стражи успешно применяют и технические и биотические способности на поле боя. Они всегда готовы к любой ситуации. После перегрузки вражеского щита Стражи могут без проблем откинуть врага при помощи своих биотических способностей. А если становиться жарко, они могут использовать Крио-заморозку и выиграть бесценные секунды, чтобы уничтожить противника или найти укрытие.

Стражи снабжены самой совершенной технической броней. При перегрузке система освобождает накопленный заряд и оглушает всех врагов, находящихся в непосредственной близости.

Полный перечень способностей:
- Бросок
- Деформация
- Перегрузка
- Техническая броня
- Крио-заморозка

Инженер

Инженеры - один из 6 классов в Mass Effect 2. Это технические специалисты, единственный класс, способный вызывать боевых дронов на поле боя. Дроны могут отвлечь огонь врага на себя и выманить их из укрытия. Инженеры могут взломать механических врагов и превратить их в мощных союзников. Усовершенствуйте ваших дронов - улучшите их оружия или превратите их в смертоносные бомбы. У инженеры есть и другие способности, такие как "Поджигание" и "Перегрузка".

Полный перечень способностей:
- Боевой дрон
- Поджигание
- Перегрузка
- Крио-заморозка
- Взлом ИИ

Штурмовик

Штурмовики снабжены имплантатами L5n, обеспечивающими их мощными биотическими способностями. В паре с их оружейной подготовкой, это смертельная комбинация в боях на коротких дистанциях. Штурмовики способны мгновенно сократить дистанцию до противника с помощью своей уникальной способности Биотический Прорыв. Обладая огромной биотической мощью, Штурмовики используют Прорыв, чтобы пересечь любые преграды, столкнуться с намеченным противником и, оторвав от земли, отправить его в полёт. Вдобавок Штурмовики могут высвободить взрывную Ударную волну, опрокидывающую врагов и вышибающую их из-за укрытий. Если Штурмовик окажется в слишком сложной ситуации, он также может использовать Прорыв, чтобы быстро переместится в безопасное место.

Полный перечень способностей:
- Инферно боеприпасы
- Усиленные криопатроны
- Биотический прорыв
- Ударная волна
- Притяжение

Разведчик

Разведчики – технические и боевые специалисты, являющиеся единственным классом, способным скрыться от обнаружения противником. Они смертоносны на любой дистанции за счёт широкого набора используемого оружия, снаряжения и умений, позволяющих поразить даже самых бронированных и защищённых врагов. Благодаря своему навыку обращения со снайперскими винтовками, Разведчики могут уничтожить противника с безопасного расстояния до попадания в очаг схватки. Вдобавок с помощью комбинирования видов боеприпасов и верной диспозиции на поле боя Разведчики могут с лёгкостью справиться как с органическими противниками, так и с синтетиками. Когда обстановка накаляется, Разведчики могут использовать Тактическую маскировку, чтобы скрыться от врагов до возвращения в бой в любом нужном месте относительно оставшихся противников.

Полный перечень способностей:
- Дезинтегрирующие боеприпасы
- Криопатроны
- Тактическая маскировка
- Поджигание
- Взлом ИИ